Zaujímavé nálezy sa podarilo nájsť v interiéri kostola. Nečakaným a vzácnym nálezom je objav fresiek v lodi kostola, o ktorých nikto ani netušil, že by mohli existovať. Na celej dĺžke severnej steny lode sa nachádza výjav Ladislavskej legendy. V západných častiach Slovenska sa tento ikonografický program objavuje len ojedinele a v takej kvalite je jediný. V rozšírenej sonde už teraz divák može obdivovať postavu svätého Ladislava kráľa na koni. V podkroví kostola pod známymi postavami sv. Mikuláša sa podarilo identifikovať postavu sv. Doroty, ktorá je označená latinským nápisom. Na severnej strane priniesol odkryv veľmi zaujímavý nález postavy sv. Stanislava, biskupa. Tento svätec bol kanonizovaný v 13. storočí a tradične je patrónom Poľska. Na stredovekej nástennej maľbe sa na území Slovenska nevyskytuje. Vo výtvarnom umení ho môžeme nájsť len na jednej tabuľovej maľbe v Spišskej Sobote.
Po pozitívnych nálezoch nad klenbou pokračoval výskum vo svätyni kostola. Na severnej stene bolo identifikované ranogotické pastofórium, čo je výklenok v stene slúžiaci na odkladanie liturgických potrieb. V novších dobách bol tento architektonický prvok nahradený dnes známym bohostánkom. V okolí pastofória sa našli dve vrstvy stredovekej maľby.
Keďže východná stena je prekrytá barokovým oltárom z 18. storočia, jedinou možnosťou overenia existencie staršej výmaľby bolo demontovanie oltáreho obrazu.
Pod ním na stene boli podpísaní realizátori oltára aj s rokom 1789. Ďaľší nápis pochádzal z roku 1936, keď sa konala veľká obnova kostola. Sonda na staršie vrstvy za oltárnym obrazom obchádza predmetné vzácne písomné správy. Zistilo sa, že po obvode svätyne boli maľby postáv apoštolov v životnej veľkosti. Najvýznamnejšie miesta mali čelom do lode sv. Peter a sv. Pavol.